Research

Finding genes for cardiovascular disease

Pagina-navigatie:

Main

Update Research data

Title	Finding genes for cardiovascular disease
Period	10 / 2004 - 10 / 2005
Status	Completed
Research number	OND1307099
Data Supplier	Nederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek (NWO)

Abstract

Aim: to trace genes that are important for cardiovascular risk factors. A full genome scan has already been made for one of the risk factors. Such scan entails the testing of 35000 genetic markers. Regular (asymptotic) significance levels are unreliable with so many tests. Empirical significance levels can be determined by 1000 permutations of the data set under the null hypothesis. On a normal processor this would take some months. Therefore cluster computers are needed.

Abstract (NL)

Het doel van het project is het opsporen van genen die van belang zijn voor risicofactoren voor cardiovasculaire ziekten. Een full genome scan is reeds uitgevoerd voor een van de risicofactoren. Een full genome scan behelst het testen van 35000 genetische markers. Reguliere (asymptotische) significantieniveau's zijn met zoveel testen onbetrouwbaar. Empirische significantieniveau's kunnen worden bepaald door middel van het uitvoeren van 1000 permutaties van de dataset onder de nulhypothese. Op een reguliere computer zou dit een aantal maanden duren.

Related organisations

Secretariat	Department of Biological Psychology (VU)
Financier	NWO National Computing Facilities Foundation (NWO)

Related people

Project leader	Prof.dr. D. Posthuma

Classification

A70000	Public health and health care
D21100	Bioinformatics, biomathematics, biomechanics
D21400	Genetics
D23220	Internal medicine