Doel
Gastro-enteritisinfecties veroorzaakt door Campylobacter betekenen jaarlijks een aanzienlijke gezondheidslast. In Nederland waren er in 2007 naar schatting 75.000 gevallen van klinische campylobacteriose in de algemene bevolking. Pluimvee is een van de belangrijkste oorzaken van het vóórkomen van Campylobacter in ons voedsel, maar dit is zeker niet de enige bron. Er is nog veel onduidelijk over de transmissieroutes van de bron naar infectie bij de mens. De juiste kwantitatieve bijdrage van pluimveevlees en die van een reeks van andere bronnen is dus nog steeds onduidelijk. Nut en effectiviteit van bestrijdingsprogramma s in pluimvee is daarom moeilijk beoordeelbaar. Bovendien zijn kennis over bronnen en transmissieroutes en van de relatie tussen besmetting van m.n. pluimvee en hun bronnen voor infectie in de omgeving, van belang om de bestrijding effectief aan te kunnen pakken.
In 2007 zijn onderzoeksresultaten beschikbaar gekomen van grootschalige studies waaruit blijkt dat multi-locus sequence typing (MLST) onderscheidt kan maken tussen m.n. Campylobacter afkomstig van pluimvee en van herkauwers, maar dat er ook, weliswaar met een aanzienlijke overlap, een gastheer associatie is met een reeks van andere bronnen. Deze techniek kan worden toegepast op C. jejuni en C. coli die samen in Nederland verantwoordelijk zijn voor bijna 99% van de humane gevallen van campylobacteriose.
Deze en andere recente studies tonen bovendien aan dat kennis over het vóórkomen van Campylobacter MLST sequence-types (ST) in de verschillende soorten gastheren en de omgeving enorm bijdraagt aan de lokale kennis van de ecologie en epidemiologie van Campylobacter. In 2008 zijn humane Campylobacter isolaten uit de patientencontrolestudie getypeerd m.b.v. de MLST methode. Het is nu de vraag in hoeverre deze humane isolaten op basis van hun MLST patroon gerelateerd kunnen worden aan isolaten uit diverse bronnen.
Dit onderzoek wordt in samenwerking met het RIVM (Dr. W. van Pelt) uitgevoerd.
Het doel van deze studie is het vaststellen van de bronattributie voor Campylobacter infecties door het bepalen van de MLST ST (sequence types) van Campylobacter stammen van veterinaire oorsprong (vleeskuikens, melkkoeien, kalveren, varkens uit het zoönosemonitoringsprogramma en gezelschapsdieren) en stammen geïsoleerd uit honden van patiënten (project geassocieerd met CASA patiëntcontrole onderzoek in 2002-2003). Dit zal in samenwerking met het RIVM worden uitgevoerd.
Werkwijze
Het typeringstraject kent een drietal fasen.
1. Opkweken van Campylobacter stammen, isoleren DNA en uitvoeren van PCRs op de 7 huishoudgenen van Campylobacter.
2. Sequencen van de PCR-producten. Er wordt op dit moment (September 2008) een pilot uitgevoerd om te bepalen hoe en waar dit het beste uitgevoerd kan worden
3. Vaststellen van de MLST STs (Sequence Types) van de afzonderlijke stammen.
Resultaten
Database met de sequenties en STs van een diverse set van Nederlandse veterinaire Campylobacter stammen. M.b.v. deze STs zullen in samen werking met het RIVM verwantschappen met humane isolaten worden bepaald. |
