Doel
Doelstelling van het project is via toepassing van darmgenomica analyses in voedingsfysiologisch onderzoek met jonge biggen nieuwe inzichten te krijgen in het functioneren en de gezondheid van het maagdarmkanaal onder invloed van variatie in de samenstelling van de voeding. Via het onderzoek zal worden vastgesteld wat het effect is van voersamenstelling op de expressie van genen in darmweefsel in relatie tot het functioneren en de gezondheid van het maagdarmkanaal.
Werkwijze
Darmgenomica analyses zullen worden uitgevoerd (genexpressieprofiling: transcriptomics m.b.v. micro-arrays; hierbij wordt de expressie van vele genen tegelijkertijd gemeten) en analyse van de expressie van geselecteerde genen (qPCR analyses)) zullen worden uitgevoerd op RNA geïsoleerd uit darmmonsters van biggen uit een tweetal studies. In beide studies werden perspectiefvolle voerbehandelingen (verschillend in grondstofsamenstelling en/of toevoeging van specifieke additieven) geëvalueerd in jonge biggen in de periode na spenen.
Uit de volgende dierstudies zijn monsters van dunne darm weefsel beschikbaar voor de uitvoering van de gen-expressie analyses;
- Invloed van lijnzaad en lijnzaadschilfers als functionele ingrediënten op de nutriëntverteerbaarheid, darmgezondheid en darmintegriteit van jonge biggen in de periode na spenen (Jansman et al, 2004)
- Effects of several plant products on prevention of E. coli adhesion in the gastrointestinal tract of weaned piglets (Jongbloed et al., 2007)
Van de beschikbare darmmonsters (duodenum/jejunum) zal mRNA worden geïsoleerd om microarray analyses te kunnen uitvoeren. Hiermee zullen verschillen in genexpressieprofielen tussen (voer)behandelingen kunnen worden gedetecteerd. Tevens zullen qPCR analyses worden uitgevoerd gericht op die specifieke genen die grote contrasten laten zien in de micro-array analyse.
Anderzijds zullen de monsters worden geanalyseerd met behulp van qPCR gericht op de analyse van specifieke genproducten waarvan uit de literatuur of uit eerder uitgevoerde studies bekend is dat deze een specifieke relatie hebben met darmfunctie en/of gezondheid [b.v. PAP, TIMP-1, MMP1, MUC-13 of nieuwe nader te identificeren markers).
De verschillen in expressie van genen zullen worden gerelateerd aan kennis in beschikbare databases over de aard en functie van het eiwit waarvoor de desbetreffende genen coderen. Vervolgens zullen relaties worden gelegd tussen de waargenomen resultaten in de studies met betrekking tot fysiologie en functie van de darm en de gemeten verschillen in genexpressie. Voorgaande geeft een meer gedetailleerd en fundamenteel inzicht in de effecten van de verschillende voerbehandelingen op de fysiologie en het functioneren van de darmwand in biggen.
Resultaten
Het project resulteert in nieuwe kennis behaald met state of the art genomics technieken welke een bijdrage zal leveren aan de verdere ontwikkeling van functional feeds gericht op het verbeteren en ondersteunen van de darmgezondheid van varkens.
Publicaties bij dit project zijn beschikbaar via deze Link |
