Onderzoek

Monitoring van effectorvariatie als toegevoegde waarde voor de P....

Pagina-navigatie:

Overzicht

Wijzig Onderzoekgegevens

Titel	Monitoring van effectorvariatie als toegevoegde waarde voor de P. infestans beheersingsstrategie
Looptijd	01 / 2010 - 12 / 2011
Status	Afgesloten
Onderzoeknummer	OND1343422

Samenvatting

Doel
Proof of principle voor de hypothese dat effectormonitoring van lokale P. infestans populatie(s) van toegevoegde waarde is voor praktische beheersing van de aardappelziekte en het duurzamer inzetten van resistentiegenen. Dit proof of principle wordt in eerste instantie onderzocht aan een systeem met Blb1 resistentie waarbij het Resistentiegen Chc1 als runner-up in het onderzoekstraject wordt meegenomen.

Werkwijze

1. Screening op de effector van Chc1 met bijbehorende allelen. De effector voor Blb1 is, met bijbehorende allelen, al bekend.
2. Genotypering van een selectie (max 20) virulente en avirulente P. infestans isolaten m.b.t. de allelen van de Blb1 en Chc1 (bij beschikbaarheid, zie a ) effectoren.
3. Fenotypering (biotoetsen en co-infiltratie) van dezelfde selectie isolaten t.b.v. bevestiging of verdere ontrafeling van de relatie tussen genotype en fenotype (virulent/avirulent) voor de allelen van de Blb1 effector.
4. Opzetten SNIP assay voor de effector allelen behorend bij Blb1 (2010) en Chc1 (2011) (BioTrove en/of qPCR) t.b.v. snelle screening P. infestans isolaten.
5. Eerste schatting van de frequentie van Blb1 virulentie inde huidige P. infestans populaties voor Lelystad en Valthermond als basis voor de eerste spuitadviezen in 2010. Idem voor Chc1 vroeg in 2011.
6. Ontwerp en uitwerking van een beheersstrategie gebaseerd op monitoring van effectorvariatie.

Praktijktoets van de hele strategie in 2 veldproeven per jaar. Rondom beide proefvelden wordt een netwerk van kleine vangveldjes (bintje) aangelegd die 1x per week gecontroleerd worden op P. infestans aantasting. Aantasting wordt verwijderd en P. infestans geïsoleerd en gekarakteriseerd. Dagelijks wordt spuitadvies uitgebracht waarin de resultaten van de P. infestans monitoring al dan niet meegewogen worden.

Resultaten

. De Chc1 effector met bijbehorende allelen.
. De relatie tussen genotype en fenotype (virulent versus avirulent) voor de effectoren behorend bij Blb1 en Chc1.
. Snelle moleculaire assays om virulentie / avirulentie te bepalen aan P. infestans isolaten voor resistentiegenen Blb1 en Chc1.
. Een ontwerp voor een P. infestans beheersingsstrategie gebasserd op monitoring van effectorvariatie.
. Proof of principle voor de gehele strategie middels twee praktijkproeven per jaar.
. Gedetailleerde data over Blb1 en Chc1 virulentie in twee lokale P. infestans populaties.
. Excursie voor Deskundigen overleg en Klankbordgroep Parapluplan en DuRPh .
. Verslag van de veldproeven op de 2 locaties.
. Per locatie: proefbezoek voor TmT netwerk.

Publicaties bij dit project zijn beschikbaar via deze Link

Samenvatting (EN)

Description:
Cultivar resistance is the most environmentally friendly and effective control measure for potato late blight. P. infestans is, however, well known for its ability to adapt and break newly introduced cultivar resistance.

Potato cultivars with a high level of resistance to potato late blight can be protected against infection by Phytophthora infestans with a much lower input of fungicides than susceptible cultivars. Resistant cultivars are therefore much less dependant on fungicides than susceptible cultivars.

The current project aims at delivering a proof of principle for the added value of effector monitoring for a practical control strategy. Daily spray advice in two large scale field experiments is adapted according to the results of virulence monitoring for specific R-genes of the local P. infestans population.

Research objectives:
1. Characterise the Chc1 effector.
. Genotype a selection of (max 20) virulent and avirulent P. infestans isolates with respect to the Blb1 en Chc1 effector alleles.
. Phenotype (bio-assays and co-infiltration) the same set of isolates for confirmation or further evaluation of the relationship between genotype and phenotype (virulent/avirulent) for the alleles of the Blb1 effector.
. Construct and test a SNIP assay for the effector allelesassociated to Blb1 (2010) and Chc1 (2011).
. Determine a first estimate for Blb1 virulence in the P. infestans population in Lelystad and Valthermond.
. Design and practical implementation of a control strategy based on effector monitoring to support the annual field experiments.
. A practical proof of principle through 2 large scale field experiments per year. Experimental control strategies will be put to the test at two locations in The Netherlands known for their high disease pressure and geneticaly diverse P. infestans population. Spray advice is issued at a daily basis taking into account the results of the effector monitoring of the local P. infestans population.

Results and products:

. The Chc1 effector including its alleles.
. The relationship between genotype and phenotype with respect to the Blb1 and Chc1 effectors.
. Quick molecular assay for virulence / avirulence for Blb1.
. Design and practical implementation of a control strategy based on effector monitoring.
. Proof of principle for a control strategy based on effector monitoring.
. Detailed data on Blb1 and Chc1 virulence in the local P. infestans populations of Lelystad and Valthermond.
. Excursion for the guiding committees of the umbrellaplan Phytophthora and DuRPh. . Excursions to view and discuss the experiments for members of the TmT network.

Betrokken organisaties

Penvoerder	Plant Research International (WUR)
Samenwerking	Praktijkonderzoek Plant & Omgeving (WUR)
Samenwerking	Laboratorium voor Plantenveredeling (WUR)
Financier	Directie Agrokennis (EL&I)

Betrokken personen

Onderzoeker	Prof.dr.ir. F.P.M. Govers
Onderzoeker	Dr. T.A.J. van der Lee
Onderzoeker	Dr.ir. H.T.A.M. Schepers
Onderzoeker	Dr. V.G.A.A. Vleeshouwers
Projectleider	Dr.ir. G.J.T. Kessel

Bovenliggende onderzoeksactiviteit(en)

Programma	BO-12.03-005 Phytophthora infestans